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華佗（林文龍）自幼聰慧過人、醉心醫學，因緣際遇下，拜名醫張仲景為師。一次，關雲長（尹揚明）帶同鄉求醫，佗發覺此人的病癥有異，不是普通傷寒，故將《傷寒論》和《滋陰論》結合，勝利切磋出治療瘟疫之法。惜農民迷信鬼神之說，加上小人得誌，對佗諸多加害，令其惹上殺身之禍。時景之長女張妙心（伍詠薇），與佗兩情相悅，決心下嫁並隨夫亡命。
好景不常，操的奸雄本色漸露，命佗制毒藥殺害關之士兵，佗不恥操所為，投靠關。操頭風病發生，惱羞成怒，以斬殺太醫院內三百余人作脅，迫佗返回許昌為其治病，佗深知此行兇多吉少，莫非這就是運氣的？